Barbara Uszczyńska-Ratajczak
Państwo działania | |
---|---|
Alma Mater |
• Politechnika Wrocławska |
Doktorat |
2013 – nauki biologiczne |
Habilitacja |
2020 – nauki biologiczne |
Pracownik naukowy | |
Instytut | |
Stanowisko |
kierownik zakładu |
Barbara Uszczyńska-Ratajczak – biolog obliczeniowa, specjalizująca się w identyfikacji i funkcjonalnej charakterystyce długich niekodujących RNA w genomach kręgowców. Od 2021 r.[1] jest kierownikiem Zakładu Biologii Obliczeniowej Niekodującego RNA (cobRNA Lab[2]) w poznańskim Instytucie Chemii Bioorganicznej PAN[3][4].
Uzystała dwa tytuły magistra: biotechnologii na Wydziale Chemicznym Politechniki Wrocławskiej oraz bioinformatyki na Wydziale Biologii Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu[5]. W 2013 r. w IChB PAN uzyskała stopień doktora nauk chemicznych na podstawie rozprawy pt. „Optymalizacja ścieżek analizy niestandardowych danych uzyskiwanych przy użyciu mikromacierzy DNA”[4][6], której promotorem był prof. Piotr Kozłowski[6]. Habilitowała się w 2021 r., również w IChB PAN, na podstawie pracy pt. „Genomiczna charakterystyka długich niekodujących RNA w genomach człowieka i myszy”[4][5].
Od 2013 roku jest członkiem międzynarodowego konsorcjum GENCODE[7]. Jej badania przyczyniły się do opracowania metod identyfikacji transkryptów w skali całych genomów. Jej prace ukazały się m.in. w czasopismach naukowych z grupy Nature. Jest laureatką stypendium MNiSW dla wybitnych młodych naukowców i Nagrody L’Oréal-UNESCO dla Kobiet i Nauki[8].
Wybrane publikacje[edytuj | edytuj kod]
- Julien Lagarde, Barbara Uszczynska-Ratajczak, Javier Santoyo-Lopez, Jose Manuel Gonzalez, Electra Tapanari, Jonathan M. Mudge, Charles A. Steward, Laurens Wilming, Andrea Tanzer, Cédric Howald, Jacqueline Chrast, Alicia Vela-Boza, Antonio Rueda, Francisco J. Lopez-Domingo, Joaquin Dopazo, Alexandre Reymond, Roderic Guigó , Jennifer Harrow , Extension of human lncRNA transcripts by RACE coupled with long-read high-throughput sequencing (RACE-Seq), „Nature Communications”, 7 (1), 2016, DOI: 10.1038/ncomms12339, PMID: 27531712, PMCID: PMC4992054 [dostęp 2024-05-31] (ang.).
- Julien Lagarde, Barbara Uszczynska-Ratajczak, Silvia Carbonell, Sílvia Pérez-Lluch, Amaya Abad, Carrie Davis, Thomas R. Gingeras, Adam Frankish, Jennifer Harrow, Roderic Guigó , Rory Johnson , High-throughput annotation of full-length long noncoding RNAs with capture long-read sequencing, „Nature Genetics”, 49 (12), 2017, s. 1731–1740, DOI: 10.1038/ng.3988, PMID: 29106417, PMCID: PMC5709232 [dostęp 2024-05-31] (ang.).
- Barbara Uszczynska-Ratajczak, Julien Lagarde, Adam Frankish, Roderic Guigó, Rory Johnson , Towards a complete map of the human long non-coding RNA transcriptome, „Nature Reviews Genetics”, 19 (9), 2018, s. 535–548, DOI: 10.1038/s41576-018-0017-y, PMID: 29795125, PMCID: PMC6451964 [dostęp 2024-05-31] (ang.).
- The ENCODE Project Consortium i inni, Perspectives on ENCODE, „Nature”, 583 (7818), 2020, s. 693–698, DOI: 10.1038/s41586-020-2449-8, PMID: 32728248, PMCID: PMC7410827 [dostęp 2024-05-31] (ang.).
- The ENCODE Project Consortium i inni, Expanded encyclopaedias of DNA elements in the human and mouse genomes, „Nature”, 583 (7818), 2020, s. 699–710, DOI: 10.1038/s41586-020-2493-4, PMID: 32728249, PMCID: PMC7410828 [dostęp 2024-05-31] (ang.).
Przypisy[edytuj | edytuj kod]
- ↑ Nowe zakłady naukowe w ICHB PAN [online], IChB PAN [dostęp 2024-05-31] .
- ↑ cobRNA Lab [online] [dostęp 2024-06-05] .
- ↑ Z-d Biologii Obliczeniowej Niekodującego RNA [online], IChB PAN [dostęp 2024-05-31] .
- ↑ a b c Dr hab. Barbara Uszczyńska-Ratajczak, [w:] baza „Ludzie nauki” portalu Nauka Polska (OPI PIB) [dostęp 2023-05-31] .
- ↑ a b Barbara Uszczynska-Ratajczak , Autoreferat [online], IChB PAN, s. 2 [dostęp 2024-06-06] .
- ↑ a b Optymalizacja ścieżek analizy niestandardowych danych uzyskiwanych przy użyciu mikromacierzy DNA w bazie „Prace badawcze” portalu Nauka Polska (OPI). [dostęp 2024-06-01].
- ↑ GENCODE [online] [dostęp 2024-05-31] .
- ↑ L’Oréal-UNESCO Dla Kobiet i Nauki [online] [dostęp 2024-05-31] .